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荧光定量PCR实验检测

点击次数:2847   发布时间:2020/9/2 8:39:16

 一、实验原理

实时荧光定量PCR Quantitative Real-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。Real-timePCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。

二、实验操作步骤:

1. 细胞培养及细胞传代

1)        倒置显微镜观察细胞,评估细胞汇合的程度以及确认无细菌和真菌污染;

2)        移去培养皿(瓶)中的培养液;

3)        加入相当于培养液体积一半的PBS清洗单层细胞,一般三次即可;

4)        1ml/25cm2表面积的量加入0.25%胰酶消化单层细胞。摇晃培养皿(瓶)使其胰蛋白酶覆盖细胞单层,倒出多余的胰蛋白酶;

5)        将培养瓶放回培养箱,放置2-10 min

6)        用倒置显微镜观察细胞以确保所有细胞都分离且漂浮,轻拍培养皿(瓶)的一侧来释放残留的贴壁细胞;

7)        用少量的含新鲜血清的培养液重悬细胞以灭活胰蛋白酶,取出100-200μl用于计数;

8)        将所需数量的细胞移至一个新标记好的温育过培养液的培养皿(瓶)中;选择适当培养条件培养细胞系;

9)        按照细胞系的生长特性重复该步骤,直到胞状态良好、无污染,可以铺板使用,其余选择冻存。

2.活细胞计数

1)        取一瓶传代的细胞,待长成单层以后使用;细胞悬液的制备方法:用0.25%的胰酶消化、PBS洗涤后,加入培养液吹打制成待测细胞悬液。

2)        盖好盖玻片,取一套血球计数槽,制备计数用的细胞悬液:用吸管吸适量细胞悬液到离心管中,加入等体积台盼蓝染液,加入染液后就可以在显微镜下区别活细胞和死细胞。若仅是单纯的进行细胞计数,不考虑细胞的活力,则可不使用台盼蓝染色。

3)        将细胞悬液滴入计数板,注意盖玻片下不要有气泡,也不要悬液流入旁边槽中。

4)        统计四个大格的细胞数,将血球计数板放于显微镜的低倍镜下观察,并移动计数板,当看到镜中出现计数方格后,数出四角的大格(每格含有16个中格)中没有被染液染上色的细胞数目。

5)        计算原细胞悬液的细胞数。按照下面公式计算细胞密度:

6)(细胞悬液的细胞数)/ml = (四个大格子细胞数/4×2×104

3.细胞处理

4.RNA提取

1)细胞中加入1ml Trizol,将细胞裂解吸到一个1.5mlEP管中;

2)加入200ul.仿,轻轻颠倒数次混匀,室温放置5分钟;

312000rpm4℃15min 4℃

4)转上层水相(约400ul)于新1.5ml EP管中,加入400ul异丙醇,混匀,室温静置10min;;

512000rpm 10min 4℃

6)弃上清,沉淀用预冷的70%无水乙醇洗3次,空气干燥5-10分钟,溶于20ulDEPC水中;

7)分光光度计测定RNA浓度。

5.RNA cDNA.一链合成

1)        将逆转所需要的物品准备好,RNA浓度计算好,tube准备并标记上;

2)        在冰浴的nuclease-free PCR管中加入试剂

3)        轻轻混匀,42度孵育15分钟。

4)        85度加热5秒失活TransScript RT/RIgDNA Remover

5)        将上述溶液-20°C保存。

6.荧光定量PCR检测

1)        cDNA样品稀释10倍作为模板上机检测。

2)        配制反应混合液

3)        PCR循环条件

4)        仪器的操作

完成上述步骤后,把加好样品的96孔板放在ABI Stepone plus型荧光定量PCR中进行反应。

原创作者:上海创凌生物科技有限公司

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